Browsing by Author "Mutso, Margit, juhendaja"

Now showing 1 - 7 of 7

Barmah Forest viiruse mutantide iseloomustamine in vitro ja in vivo
(Tartu Ülikool, 2020) Omler, Ailar; Merits, Andres, juhendaja; Mutso, Margit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Barmah forest viirus (BFV) on Austraalias ulatuslikult leviv artriite põhjustav alfaviirus, mis põhjustab igal aastal ligikaudu 1000 registreeritud haigusjuhtu. Käesolevas töös kirjeldati lähemalt BFV nsP3 tuumalokalisatsiooni ja näidati, et see sõltub C-terminaalses domeenis paiknevast tuumalokalisatsiooni signaalist. Näidati ka seda, et nsP3 lokalisatsioon rakutuuma leiab aset imetajarakkude nakatamisel, kuid mitte putukarakkudes. Samuti ei mõjutanud selle omaduse puudumine viiruse replikatsioonikineetikat putukarakkudes. nsP3 tuumalokalisatsiooni signaali häirimine põhjustas BFV atenueerimist tüüp I IFN kompetentsete rakkude nakatamisel ning madalamaid viiruse tiitreid nakatatud C57BL/6 hiirte kudedes. Sellest järeldati, et BFV nsP3 lokalisatsioon rakutuuma võib mõjutada peremeesraku geeniekspressiooni ja/või tüüp I IFN süsteemi kaudset viirusvastase oleku kujunemist. Lisaks iseloomustati kahe nsP2 ja nsP4 järjestuses paikneva mutatsiooni mõju BFV replikatsioonile ning nende positsioonide olulisust seostati tüüp I IFN vastuse allareguleerimisega peremeesrakus.
Characterization of the TRMT112-methyltransferase network in mammalian cells
(Tartu Ülikool, 2021) Brūmele, Baiba; Kurg, Reet, juhendaja; Mutso, Margit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
TRMT112 is a small evolutionary conserved protein that acts as a co-factor and activator for different methyltransferases involved in rRNA, tRNA and protein methylation. In mammalian cells TRMT112 interacts with WBSCR22, N6AMT1, METTL5, ALKBH8, TRMT11, THUMPD2 and THUMPD3. During this research subcellular localisation and mutual interactions of TRMT112 and its partners were studied. TRMT112 level and localization in the cells is tightly regulated and there is a positive feedback loop between TRMT112 and its partners. TRMT112 interacts with all its partners in a similar way, but single amino acid mutations on the surface of TRMT112 reveal several differences as well. Lastly, partial genomic knockout of TRMT112 using CRISPR/Cas9 system significantly reduces WBSCR22 protein level in mammalian cells. In summary, mammalian TRMT112 can be considered as a central “hub” protein that regulates the activity of several of the methyltransferases it interacts with.
Chikungunya viiruse mittestruktuurse valgu nsP3 ja raku valgu CD2AP vahelise interaktsiooni uurimine
(Tartu Ülikool, 2015-09-01) Tarve, Liisi; Merits, Andres, juhendaja; Varjak, Margus, juhendaja; Mutso, Margit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Metüültransferaasi N6AMT1 roll β-tubuliini isotüüpide ja mikrotuubulite dünaamika regulatsioonis
(Tartu Ülikool, 2024) Suija, Mihkel; Mutso, Margit, juhendaja; Kurg, Reet, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
N6AMT1 on evolutsiooniliselt konserveerunud metüültransferaas, mis osaleb erinevate rakuliste protsesside, nagu migratsioon, rakkude jagunemine ja apoptoos, regulatsioonis. Magistritöö käigus uuriti muutusi β-tubuliini isotüüpide osakaalus ja mikrotuubulite dünaamikas osteosarkoomi rakkudes, kus N6AMT1 oli vaigistatud. N6AMT1 vaigistamine muutis rakkudes olevate β-tubuliini isotüüpide omavahelist osakaalu läbi transkriptsiooni, kuid ei vähendanud oluliselt üldist tubuliinide sisaldust. Samuti leiti, et N6AMT1 vaigistamine suurendas mikrotuubulite kasvukiirust ja pikkust kuid aeglustas potentsiaalselt tsentrosomaalse nukleatsiooni kiirust. Lõpuks näidati läbi ko-immunopretsipitatsiooni, et N6AMT1 ja teised TRMT112-ga interakteeruvad metüültransferaasid WBSCR22, THUMPD2, THUMPD3 ja TRMT11 võivad interakteeruda tubuliinidega. Kokkuvõttes selgus töö tulemusel, et metüültransferaasil N6AMT1 on oluline roll mikrotuubulite dünaamika regulatsioonis, mille funktsioonaalne tähendus vajab aga edasist uurimist.
Metüültransferaaside ko-faktori TRMT112 mutatsioonanalüüs
(Tartu Ülikool, 2021) Sarap, Robert Johannes; Mutso, Margit, juhendaja; Kurg, Reet, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Metülatsioon on biokeemiline protsess, mis omab mitmeid olulisi rolle geenide ekspressioonis ja kasvajate tekkes. Reguleerimata metülatsioon on tihedalt seotud paljude terviseprobleemidega. Metülatsiooni viivad läbi metüültransferaasid, mis transpordivad metüülrühma sihtmärgile. Metüültransferaasid vajavad oma metaboolse stabiilsuse ja ensümaatilise aktiivsuse jaoks ko-faktorit TRMT112. Käesoleva bakalaureusetöö eesmärgiks oli uurida, kuidas mõjutavad TRMT112 mutatsioonid valgu stabiilsust ja ekspressiooni ning seondumist metüültransferaasidega
Regulation of the cell cycle to cytoskeleton remodelling: the diverse functions of N6AMT1
(Tartu Ülikool, 2023) Serova, Evgeniia; Mutso, Margit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Tehnoloogiainstituut
N6AMT1, also known as HEMK2, is an evolutionally conserved protein which belongs to the human TRMT112-methyltransferase network. It is involved in the methylation of various substrates. Previous studies have shown that this significant methyltransferase is engaged in the majority of vital processes like regulating of cell proliferation, cell cycle factors, etc. Therefore, in the present research, it was studied how the depletion of N6AMT1 affected the viability of U2OS cells. Using CRISPR/Cas9 genome editing system we obtained an N6AMT1 knock-out cell line that showed stunted growth, delayed cell cycle progression, and alterations in morphology. Moreover, it was noticed that N6AMT1 reduction had an impact on cytoskeleton remodelling, namely the β-tubulin level. In conclusion, human N6AMT1 was considered as a potential target responsible for cell cycle and cell cytoskeleton remodelling.
Valgu N6AMT1 funktsioon imetaja rakuliinides
(Tartu Ülikool, 2024) Kärner, Ülleri; Mutso, Margit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Metüültransferaasina toimivat N6AMT1 valku on seostatud rakutsükli regulatsiooni ja vähkkasvaja arenemisega mitmetes imetaja rakuliinides ning on seetõttu kirjeldatud kui potentsiaalset kasvajamarkerit. Seetõttu on oluline uurida N6AMT1 valgu funktsiooni, et mõista täpseid rakulisi mehhanisme ning leida valgu potentsiaalseid kasutusvaldkondi meditsiinis. Bakalaureusetöö eesmärk oli N6AMT1 knockout rakuliini toel uurida valgu funktsiooni rakutsüklis ning mõju tuumamorfoloogiale.