Browsing by Author "Vaher, Mihkel"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 3 of 3
  • Thumbnail Image
    Item
    Asp333, Phe381 ja Val385 olulisus Pseudomonas syringae pv. tomato levaansukraasi Lsc3 katalüüsile
    (Tartu Ülikool, 2013) Vaher, Mihkel; Alamäe, Tiina, juhendaja; Visnapuu, Triinu, juhendaja; Mardo, Karin, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
  • Thumbnail Image
    Item
    Bakteritüvede tuvastamine sekveneerimise toorlugemitest kindla pikkusega oligomeeride abil
    (Tartu Ülikool, 2016) Vaher, Mihkel; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Teise põlvkonna sekveneerimine võimaldab anda hulgaliselt infot proovide liigilise koosluse kohta, olgu selleks näiteks inimese mikrobioomi- või keskkonnaproov. Uuemad bakterite tuvastamise programmid kasutavad määramiseks lühikesi kindla pikkusega oligomeere, olles seeläbi kiired, kuid ka mitmete puudustega. Antud töö käigus loodi tarkvara StrainSeeker, mis tuvastab sekveneerimise toorandmetest bakterid tüve tasemeni. StrainSeeker analüüsib kõigi lugemite koondinfot, mitte üksikuid lugemeid eraldi. Lisaks suudab StrainSeeker tuvastada ka andmebaasist puuduvaid organisme ning kiirus ja paindlikkus teevad selle võrreldavaks parimate avaldatud bakterite tuvastamise programmidega.
  • Thumbnail Image
    Item
    Inimeste hoiakud elektriautode suhtes
    (Tartu Ülikool, 2016) Vaher, Mihkel; Poltimäe, Helen, juhendaja; Tartu Ülikool. Majandusteaduskond