Alfaviiruste replikaasi jagamine funktsionaalseteks komponentideks Sindbis, Chikungunya ja Ross River viiruste näitel
Kuupäev
2018
Autorid
Ajakirja pealkiri
Ajakirja ISSN
Köite pealkiri
Kirjastaja
Tartu Ülikool
Abstrakt
Alfaviirused on Togaviridae sugukonda kuuluv positiivse polaarsusega RNA genoomsete
viiruste perekond. Alfaviiruste genoom kodeerib mittestruktuurseid valke, mis sünteesitakse
liitvalguna. Funktsionaalne replikaas moodustub liitvalgu lõikamise teel. Seni ei ole suudetud
sellist kompleksi individuaalsetest komponentidest konstrueerida. See ajendas meie
uurimisgrupi ning Antwerpeni Troopilise Meditsiini Instituudi teadlaseid uurima alfaviiruste
replikaasi rekonstrueerimist valmis- ja liitvalkudest ning RNA maatritsist. Käesoleva töö
eesmärgiks oli selleks vajalike töövahendite kavandamine, valmistamine ning katsetamine.
Analüüsiti kahest ja kolmest komponendist moodustatud replikaaside funktsionaalsust. Lisaks
määrati replikaasi kompleksi moodustavate komponentide optimaalsed vahekorrad ja uuriti, kas sellised replikaasid säilitavad oma bioloogilised omadused. See bakalaureuse töö näitab Ross River, Sindbis ja Chikungunya viiruste näidetel, et nende replikaase saab
rekonstrueerida kahest- ja mõnel juhul ka kolmest komponendist ning rajab seega aluse
alfaviiruste replikaasi moodustumise ja toimimise põhjalikuks uurimiseks.
Kirjeldus
Märksõnad
alfaviirused, RRV, SINV, CHIKV, replikaas, nsP4, transreplikatsiooni süsteem