Jämesoolevähi riskitegurid TÜ Eesti Geenivaramu andmete põhjal

Abstract

Bakalaureusetöö eesmärk on leida jämesoolevähi mittegeneetilised riskitegurid ning uurida geneetilise riskiskoori mõju jämesoolevähile. Lisaks uuritakse, kui hästi leitud mittegeneetilised riskitegurid ja geneetiline riskiskoor jämesoolevähki prognoosivad. Töös kasutatakse Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmeid, kus on üle 48 000 geenidoonori. Andmete analüüsimisel kasutatakse elukestusanalüüsi meetodeid. Seejuures arvestatakse, et tegemist on vasakult tõkestatud ja paremalt tsenseeritud andmetega, ning ajaskaalana kasutatakse vanust. Töö teoreetilises osas antakse ülevaade jämesoolevähist, elukestusanalüüsist, geneetilisest riskiskoorist ning ROC-kõveratest. Töö praktilises osas kirjeldatakse andmeid ning leitakse jämesoolevähki prognoosivad tunnused. Seejärel jagatakse andmestik treening- ja testandmestikuks. Treeningandmestikus leitakse jämesoolevähki prognoosivad mudelid ning testandmestikus prognostilised skoorid ja ROC-kõverate abil prognooside täpsused.