Ülegenoomsete geen-geen koosmõjude hindamise meetodi valideerimine
Kuupäev
2014-06-16
Autorid
Ajakirja pealkiri
Ajakirja ISSN
Köite pealkiri
Kirjastaja
Tartu Ülikool
Abstrakt
Käesoleva bakalaureusetöö eesmärgiks on uue meetodi valideerimine geen-geen koosmõjude uurimiseks ülegenoomsetes assotsiatsiooniuuringutes. Esmalt tuuakse ülevaade ülegenoomsetest uuringutest ja seal kasutatavast statistilisest metoodikast ning bioloogilise ja statistilise koosmõju mõistetest. Järgnevalt kirjeldatakse kahte meetodit, mille abil koosmõjusid määrata, ning rakendatakse neid simuleeritud andmetel ja Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmetel. Esimene meetod reaalsetel andmetel ei tööta, kuid teine meetod annab rahuldavaid tulemusi. Teist meetodit plaanitakse rakendada uues geen-geen koosmõjude määramise programmis.
Kirjeldus
Märksõnad
geneetilised assotsiatsiooniuuringud, interaktsioonid, statistilised meetodid, valideerimine