Endo-levanaas BT1760: hüpoteetilise CBM-motiivi rolli uurimine

Abstract

Levaan on polüfruktaan, mis toimib inimese soolestikus prebiootiliselt. Selles polüsahhariidis on fruktoosi monomeeride vahel β-2,6-side, mida Bacteroides thetaiotaomicron’i genoomis kodeeritud endo-levanaas BT1760 hüdrolüüsib, lõigates polümeeri ahela oligomeerideks. Valk BT1760 koosneb N-terminaalsest katalüütilisest domeenist ning C-terminaalest β-sandwich domeenist. C-terminaalne β-sandwich domeen on glükosiidi hüdrolaasidel sageli vajalik süsivesikutega seondumiseks ning sel juhul nimetatakse neid motiive süsivesikuga seonduvateks domeenideks ehk CBM-deks (Carbohydrate Binding Modules). Käesolevas töös on uuritud endo-levanaas BT1760 C-terminaalse domeeni rolli kasutades metsiktüüpi valgust moodustatud mutantseid variante ning mõõtes nende substraadi hüdrolüüsimise aktiivsust ja levaanidega seondumise võimet.