Vedelbiopsiapõhine SNP-genotüpiseerimine täppis- ja personaalmeditsiinis
Date
2021
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Rakuvaba DNA (circulating free DNA, cfDNA) on fragmenteerunud DNA, mida leidub
peamiselt veres. CfDNA esinemine veres on normaalne füsioloogiline nähtus, sest DNA
vabaneb pidevalt apoptootilistest rakkudest. Raseduse, kasvaja ja siirdatud organi
äratõukereaktsiooni tulemusel vabaneb cfDNA ka eelnimetatud põhjusest. Seega on cfDNA
tõhus mitteinvasiivne biomarker, mis võimaldab anda dünaamilist ja täpset hinnangut patsiendi
või loote tervisele. Lisaks on võimalik raseduse ajal viia läbi sünnieelset cfDNA-põhist
isadustesti. CfDNA analüüsil kasutatakse erinevaid lähenemisi, millest üks on
ühenukleotiidsete polümorfismide (SNP) genotüpiseerimine. Käesoleva töö eesmärgid on (i)
anda ülevaade cfDNA analüüsi meetoditest, (ii) iseloomustada PCR-praimerite disaini
parameetreid cfDNA analüüsiks ja (iii) leida vajaminevate SNP-de hulk sünnieelse isaduse
tuvastamise näitel.
Description
Keywords
rakuvaba DNA, ddcfDNA, tuumori DNA, SNP, genotüpiseerimine