Põhjuslikud mudelid Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu metaboloomika ja toitumise andmetel
Date
2015
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Käesolevas magistritöös uuritakse põhjuslikke seoseid kohvi tarbimise, metaboliitide kontsentratsiooni taseme ja vererõhu vahel, kasutades Mendeli randomiseerimise meetodit. Riskitegurite põhjusliku mõju hindamisel huvipakkuvale haigusele või tervisenäitajale, on nimetatud meetodi korral instrumenttunnusena kasutusel geneetilised markerid, mille mõju eksponenttunnusele on teada. Töös on otsitavatele parameetritele hinnangud leitud nii Mendeli randomiseerimist kui ka lineaarset regressioonanalüüsi kasutades. Ilmnes, et lineaarne regressioonanalüüs annab küll statistiliselt olulised seosed, ent Mendeli randomiseerimisel saadud tulemuste põhjal ei ole võimalik kinnitada seose põhjuslikkust. Lisaks pakutakse töös välja Mendeli randomiseerimise meetodi edasiarendus juhule, kus põhjuslik seoseahel on keerukam. Simulatsioonieksperiment kinnitab, et meetodi edasiarendus annab eelduste kehtimise korral soovitud tulemused. Reaalsete andmete korral osutusid instrumenttunnused aga liiga nõrgaks, et soovitud täpsusega tulemusi saada.
Description
Keywords
randomiseerimine, regressioonanalüüs, geneetiline muutlikkus, põhjuslikkus, geenid, ühenukleotiidsed polümorfismid