Browsing by Author "Helekivi, Kristi"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Item
    Põhjuslikud mudelid Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu metaboloomika ja toitumise andmetel
    (Tartu Ülikool, 2015) Helekivi, Kristi; Fischer, Krista, juhendaja; Tartu Ülikool. Matemaatika-informaatikateaduskond; Tartu Ülikool. Matemaatilise statistika instituut
    Käesolevas magistritöös uuritakse põhjuslikke seoseid kohvi tarbimise, metaboliitide kontsentratsiooni taseme ja vererõhu vahel, kasutades Mendeli randomiseerimise meetodit. Riskitegurite põhjusliku mõju hindamisel huvipakkuvale haigusele või tervisenäitajale, on nimetatud meetodi korral instrumenttunnusena kasutusel geneetilised markerid, mille mõju eksponenttunnusele on teada. Töös on otsitavatele parameetritele hinnangud leitud nii Mendeli randomiseerimist kui ka lineaarset regressioonanalüüsi kasutades. Ilmnes, et lineaarne regressioonanalüüs annab küll statistiliselt olulised seosed, ent Mendeli randomiseerimisel saadud tulemuste põhjal ei ole võimalik kinnitada seose põhjuslikkust. Lisaks pakutakse töös välja Mendeli randomiseerimise meetodi edasiarendus juhule, kus põhjuslik seoseahel on keerukam. Simulatsioonieksperiment kinnitab, et meetodi edasiarendus annab eelduste kehtimise korral soovitud tulemused. Reaalsete andmete korral osutusid instrumenttunnused aga liiga nõrgaks, et soovitud täpsusega tulemusi saada.
  • Thumbnail Image
    Item
    Toitumise seosed lipoproteiinidega Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmestikus: korreleeritud andmete mitmemõõtmeline analüüs
    (Tartu Ülikool, 2013-06-06) Helekivi, Kristi; Fischer, Krista, juhendaja; Tartu Ülikool. Matemaatika-informaatikateaduskond; Tartu Ülikool. Matemaatilise statistika instituut
    Antud bakalaureusetöös on Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmete põhjal vaadeldud võimalikke seoseid inimeste toitumisharjumuste ja metaboloomika-tunnuste vahel. Metaboliidid on metabolismi ehk ainevahetuse käigus tekkinud ühendid. Tavaliselt mõeldakse metaboliidi all madalmolekulaarseid ühendeid [1]. Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmebaasis on ligikaudu 10 000 geenidoonori kohta olemas detailsed metaboloomika-andmed, mille hulgas on üle 70 tunnuse, mis iseloomustavad eri tüüpi lipoproteiinide ja neis sisalduvate lipiidide kontsentratsiooni. Lisaks on teada andmed geenidoonorite toitumiseelistuste kohta ning doonorite sugu, vanus ja kehamassiindeks. Töö esimeses peatükis on kirjeldatud kasutatavate andmete tausta ning on antud ülevaade olulisemate tunnuste jaotusest, kasutades graafilisi meetodeid. Teises peatükis on toodud ülevaade kasutatavast statistilisest meetodikast. Kolmandas ning neljandas peatükis rakendatakse metoodikat Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmetele. Lipoproteiinide andmestiku dimensionaalsuse vähendamiseks rakendatakse andmetele esmalt peakomponentanalüüsi ning seejärel faktoranalüüsi. Samuti uuritakse toitumistunnuste seoseid nii üksikute lipoproteiinidega kui ka lipoproteiinide analüüsimisel saadud peakomponentide ja faktoritega. Lõpuks on katsetatud struktuurivõrrandite mudelite metoodikat, mis võimaldab ühe protseduuri käigus nii andmestiku dimensionaalsuse vähendamist kui ka seosestruktuuri uurimist. Bakalaureusetöö kirjutamiseks on kasutatud tekstitöötlusprogrammi Microsoft Word 2010. Analüüsid on läbi viidud statistikapaketiga R. Joonised on tehtud programmidega Microsoft Excel 2010 ja Graphviz 2.30.1.