Browsing by Author "Lvovs, Aneth"

Now showing 1 - 3 of 3

Cholecystokinin B receptor gene polymorphism (rs2941026) is associated with anxious personality and suicidal thoughts in a longitudinal study
(2022) Lvovs, Aneth; Matrov, Denis; Kurrikoff, Triin; Veidebaum, Toomas; Harro, Jaanus
Objectives: Cholecystokinin is a neuropeptide with a role in the neurobiology of adaptive behaviour that is implicated in anxiety disorders, while the underlying mechanisms currently remain insufficiently explained. The rs2941026 variation in the cholecystokinin B receptor gene has previously been associated with trait anxiety. Our aim was to investigate associations between the CCKB receptor gene polymorphism rs2941026 with anxiety, personality, depressiveness and suicidality in a longitudinal study of late adolescence and early adulthood. Methods: We used reports on trait and state anxiety, depressiveness and suicidal thoughts, as well as Affective Neuroscience Personality Scales, from the two birth cohorts of the Estonian Children Personality, Behaviour and Health Study. We measured associations between the CCKBR gene rs2941026 and anxiety-related phenotypes both longitudinally and cross-sectionally at ages 15, 18, 25 and 33. Results: Homozygosity for both alleles of the CCKBR rs2941026 was associated with higher trait and state anxiety in the longitudinal analysis. Cross-sectional comparisons were statistically significant at ages 18 and 25 for trait anxiety and at ages 25 and 33 for state anxiety. Higher depressiveness and suicidal thoughts were associated with the A/A genotype at age 18. Additionally, homozygosity for the A-allele was related to higher FEAR and SADNESS in the Affective Neuroscience Personality Scales. The genotype effects were more apparent in females, who displayed higher levels of negative affect overall. Conclusions: CCKBR genotype is persistently associated with negative affect in adolescence and young adulthood. The association of the CCKBR rs2941026 genotype with anxiety-related phenotypes is more pronounced in females.
Endogeensete viiruslike elementide tuvastamine parameetriliste meetoditega bornaviiruse sarnaste elementide näitel
(Tartu Ülikool, 2019) Lvovs, Aneth; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Horisontaalne geeniülekanne on geneetilise materjali paaritumisest sõltumatu liikumine ühest organismist teise. Endogeensed viiruslikud elemendid on horisontaalse geeniülekande tagajärjel tekkinud, peremehe genoomi integreerunud ja fikseerunud viiruse genoomsed fragmendid. Senini on endogeenseid viiruslikke elemente tuvastatud homoloogia otsimisega viiruslike ja eukarüootsete järjestuste vahel. Tänaseks on horisontaalse geeniülekande tuvastamiseks loodud parameetrilised programmid, mis otsivad ülekandunud piirkondi kiirelt ühe järjestuse põhjal. Parameetrilisi meetodeid ei ole senini endogeensete viiruslike elementide tuvastamisel kirjeldatud, mistõttu on käesoleva töö eesmärgiks selgitada parameetriliste programmide kasutamise võimalusi endogeensete bornaviiruse sarnaste elementide näitel.
Pseudomonas putida pseudouridiini süntaas RluA
(Tartu Ülikool, 2017) Lvovs, Aneth; Tagel, Mari, juhendaja; Ilves, Heili, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
RNA modifitseerimine on universaalne ja konserveerunud protsess. Erinevad modifikatsioonid stabiliseerivad RNA struktuuri, suurendavad translatsiooni efektiivsust ja täpsust ning võimaldavad isegi alternatiivset koodonkasutust. Kõige sagedasem RNA modifikatsioon on pseudouridiin. Meie laboris on varasemalt leitud seos tRNA antikoodoni läheduses paiknevate pseudouridiinide ja mutatsioonisageduse vahel bakteris Pseudomonas putida. RluA on pseudouridiini süntaas, mis sünteesib pseudouridiine rRNA-sse ning tRNA antikoodoni lähedusse. Käesolevas töös uurisime RluA sünteesitavate pseudouridiinide seost mutatsioonisagedusega Pseudomonas putidas.