Geneetiliste päritolukomponentide määramine mitmemõõtmelise statistika meetodite abil

Date

2015

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Tartu Ülikool

Abstract

Käesoleva bakalaureusetöö eesmärk on uurida erinevaid võimalusi indiviidi päritolu kirjeldamiseks geeniandmetel põhinevate tõenäosuslike päritolukomponentide abil. Töö teoreetilises osas antakse ülevaade vajalikest geneetika mõistetest ning kasutatavatest statistilistest meetoditest. Töö praktilises pooles hinnatakse päritolukomponentide skoore peakomponentanalüüsi ning lineaarse diskriminantanalüüsi meetodite kombineerimisel. Tulemuste põhjal leitakse aposterioorsed eri rahvusgruppidesse kuulumise tõenäosused TÜ Eesti Geenivaramu andmebaasist pärinevale valimile. Lisaks uuritakse saadud tulemuste seoseid erinevate fenotüübiliste tunnustega ning samuti teostatakse võrdlused analoogsete tõenäosustega, mis on leitud alternatiivsel meetodil – TÜ Eesti Geenivaramu teadlaste poolt välja töötatud MixFit algoritmi põhjal.

Description

Keywords

päritolu, peakomponentanalüüs, diskriminantanalüüs

Citation